Protein–RNA interactions for Protein: P40200

CD96, T-cell surface protein tactile, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD96P40200 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD96P40200 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD96P40200 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD96P40200 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD96P40200 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD96P40200 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD96P40200 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD96P40200 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD96P40200 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD96P40200 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD96P40200 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD96P40200 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD96P40200 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD96P40200 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD96P40200 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD96P40200 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD96P40200 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CD96P40200 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD96P40200 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD96P40200 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD96P40200 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD96P40200 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD96P40200 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD96P40200 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD96P40200 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD96P40200 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD96P40200 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD96P40200 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD96P40200 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD96P40200 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD96P40200 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD96P40200 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD96P40200 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD96P40200 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD96P40200 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD96P40200 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD96P40200 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD96P40200 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD96P40200 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD96P40200 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD96P40200 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD96P40200 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD96P40200 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD96P40200 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD96P40200 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD96P40200 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD96P40200 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD96P40200 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD96P40200 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD96P40200 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD96P40200 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD96P40200 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD96P40200 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD96P40200 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD96P40200 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD96P40200 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD96P40200 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD96P40200 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD96P40200 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD96P40200 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD96P40200 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD96P40200 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD96P40200 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD96P40200 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD96P40200 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD96P40200 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD96P40200 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD96P40200 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD96P40200 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD96P40200 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD96P40200 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD96P40200 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD96P40200 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD96P40200 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD96P40200 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD96P40200 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD96P40200 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD96P40200 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD96P40200 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD96P40200 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD96P40200 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD96P40200 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD96P40200 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD96P40200 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD96P40200 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD96P40200 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD96P40200 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD96P40200 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD96P40200 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD96P40200 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD96P40200 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD96P40200 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD96P40200 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms