Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPGP40121 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPGP40121 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPGP40121 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPGP40121 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPGP40121 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPGP40121 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPGP40121 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPGP40121 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPGP40121 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPGP40121 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPGP40121 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPGP40121 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPGP40121 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPGP40121 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPGP40121 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPGP40121 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPGP40121 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPGP40121 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPGP40121 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPGP40121 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPGP40121 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPGP40121 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPGP40121 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPGP40121 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPGP40121 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPGP40121 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPGP40121 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPGP40121 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPGP40121 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPGP40121 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPGP40121 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPGP40121 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPGP40121 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPGP40121 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPGP40121 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPGP40121 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPGP40121 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPGP40121 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPGP40121 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPGP40121 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPGP40121 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPGP40121 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPGP40121 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPGP40121 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPGP40121 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPGP40121 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPGP40121 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPGP40121 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPGP40121 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPGP40121 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPGP40121 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPGP40121 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPGP40121 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPGP40121 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPGP40121 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPGP40121 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPGP40121 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPGP40121 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPGP40121 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPGP40121 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPGP40121 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPGP40121 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPGP40121 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPGP40121 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPGP40121 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPGP40121 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPGP40121 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPGP40121 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPGP40121 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPGP40121 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPGP40121 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPGP40121 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPGP40121 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPGP40121 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPGP40121 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPGP40121 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPGP40121 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPGP40121 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPGP40121 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPGP40121 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPGP40121 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPGP40121 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPGP40121 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPGP40121 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPGP40121 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPGP40121 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPGP40121 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPGP40121 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPGP40121 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPGP40121 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPGP40121 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPGP40121 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPGP40121 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPGP40121 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPGP40121 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPGP40121 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms