Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNF1BP35680 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNF1BP35680 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HNF1BP35680 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNF1BP35680 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms