Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP214P35658 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP214P35658 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP214P35658 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP214P35658 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP214P35658 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP214P35658 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP214P35658 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP214P35658 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP214P35658 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP214P35658 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP214P35658 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP214P35658 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP214P35658 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP214P35658 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP214P35658 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP214P35658 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP214P35658 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP214P35658 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP214P35658 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP214P35658 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP214P35658 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP214P35658 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP214P35658 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP214P35658 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP214P35658 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP214P35658 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP214P35658 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP214P35658 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP214P35658 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP214P35658 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP214P35658 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP214P35658 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP214P35658 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP214P35658 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP214P35658 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP214P35658 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP214P35658 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP214P35658 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP214P35658 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP214P35658 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP214P35658 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP214P35658 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP214P35658 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP214P35658 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP214P35658 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP214P35658 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP214P35658 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP214P35658 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP214P35658 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP214P35658 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP214P35658 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP214P35658 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP214P35658 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP214P35658 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP214P35658 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP214P35658 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP214P35658 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP214P35658 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP214P35658 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP214P35658 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP214P35658 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP214P35658 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP214P35658 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP214P35658 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP214P35658 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP214P35658 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP214P35658 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP214P35658 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP214P35658 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP214P35658 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP214P35658 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP214P35658 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP214P35658 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP214P35658 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP214P35658 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP214P35658 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP214P35658 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP214P35658 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms