Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA3P35244 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA3P35244 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA3P35244 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA3P35244 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPA3P35244 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPA3P35244 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPA3P35244 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA3P35244 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA3P35244 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA3P35244 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA3P35244 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA3P35244 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA3P35244 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA3P35244 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPA3P35244 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA3P35244 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA3P35244 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA3P35244 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA3P35244 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA3P35244 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA3P35244 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPA3P35244 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA3P35244 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA3P35244 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA3P35244 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA3P35244 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPA3P35244 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA3P35244 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA3P35244 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA3P35244 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA3P35244 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPA3P35244 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA3P35244 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA3P35244 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA3P35244 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA3P35244 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA3P35244 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA3P35244 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA3P35244 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA3P35244 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA3P35244 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA3P35244 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA3P35244 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA3P35244 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA3P35244 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPA3P35244 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA3P35244 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA3P35244 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA3P35244 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA3P35244 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA3P35244 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA3P35244 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA3P35244 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA3P35244 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA3P35244 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA3P35244 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA3P35244 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA3P35244 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA3P35244 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA3P35244 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPA3P35244 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA3P35244 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA3P35244 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA3P35244 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA3P35244 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA3P35244 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA3P35244 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA3P35244 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA3P35244 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA3P35244 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA3P35244 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA3P35244 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA3P35244 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA3P35244 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA3P35244 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA3P35244 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA3P35244 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA3P35244 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA3P35244 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA3P35244 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA3P35244 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA3P35244 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA3P35244 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA3P35244 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA3P35244 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA3P35244 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA3P35244 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA3P35244 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA3P35244 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms