Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BMI1P35226 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BMI1P35226 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BMI1P35226 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BMI1P35226 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMI1P35226 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMI1P35226 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMI1P35226 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMI1P35226 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMI1P35226 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMI1P35226 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMI1P35226 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMI1P35226 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMI1P35226 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMI1P35226 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMI1P35226 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMI1P35226 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMI1P35226 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMI1P35226 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMI1P35226 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMI1P35226 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BMI1P35226 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMI1P35226 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMI1P35226 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMI1P35226 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMI1P35226 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMI1P35226 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMI1P35226 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMI1P35226 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMI1P35226 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMI1P35226 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMI1P35226 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMI1P35226 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMI1P35226 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BMI1P35226 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BMI1P35226 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BMI1P35226 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BMI1P35226 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BMI1P35226 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BMI1P35226 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BMI1P35226 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BMI1P35226 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BMI1P35226 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BMI1P35226 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BMI1P35226 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BMI1P35226 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BMI1P35226 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BMI1P35226 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BMI1P35226 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BMI1P35226 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BMI1P35226 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BMI1P35226 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BMI1P35226 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BMI1P35226 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BMI1P35226 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BMI1P35226 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BMI1P35226 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BMI1P35226 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMI1P35226 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BMI1P35226 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMI1P35226 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMI1P35226 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMI1P35226 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMI1P35226 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMI1P35226 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMI1P35226 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMI1P35226 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMI1P35226 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMI1P35226 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMI1P35226 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMI1P35226 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMI1P35226 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMI1P35226 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMI1P35226 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BMI1P35226 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BMI1P35226 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BMI1P35226 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms