Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNSP34059 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNSP34059 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNSP34059 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNSP34059 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNSP34059 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNSP34059 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNSP34059 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNSP34059 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNSP34059 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNSP34059 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNSP34059 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNSP34059 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNSP34059 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNSP34059 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNSP34059 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNSP34059 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNSP34059 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNSP34059 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNSP34059 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNSP34059 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNSP34059 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNSP34059 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNSP34059 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GALNSP34059 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNSP34059 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNSP34059 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNSP34059 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNSP34059 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNSP34059 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNSP34059 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNSP34059 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNSP34059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNSP34059 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNSP34059 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNSP34059 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNSP34059 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNSP34059 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNSP34059 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNSP34059 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNSP34059 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNSP34059 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNSP34059 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNSP34059 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNSP34059 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNSP34059 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNSP34059 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNSP34059 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNSP34059 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNSP34059 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNSP34059 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNSP34059 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNSP34059 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNSP34059 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNSP34059 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNSP34059 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNSP34059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GALNSP34059 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNSP34059 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNSP34059 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNSP34059 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNSP34059 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNSP34059 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNSP34059 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNSP34059 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNSP34059 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNSP34059 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNSP34059 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALNSP34059 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GALNSP34059 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNSP34059 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNSP34059 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNSP34059 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNSP34059 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNSP34059 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNSP34059 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNSP34059 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNSP34059 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNSP34059 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNSP34059 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNSP34059 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNSP34059 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNSP34059 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNSP34059 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNSP34059 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNSP34059 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNSP34059 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNSP34059 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALNSP34059 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms