Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3AP31941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3AP31941 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC3AP31941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3AP31941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms