Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB6P28072 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB6P28072 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB6P28072 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB6P28072 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms