Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YY1P25490 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
YY1P25490 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YY1P25490 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YY1P25490 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YY1P25490 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
YY1P25490 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
YY1P25490 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
YY1P25490 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
YY1P25490 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
YY1P25490 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
YY1P25490 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
YY1P25490 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YY1P25490 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YY1P25490 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
YY1P25490 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YY1P25490 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YY1P25490 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
YY1P25490 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
YY1P25490 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
YY1P25490 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
YY1P25490 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
YY1P25490 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
YY1P25490 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
YY1P25490 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
YY1P25490 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
YY1P25490 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
YY1P25490 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
YY1P25490 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
YY1P25490 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
YY1P25490 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
YY1P25490 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
YY1P25490 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
YY1P25490 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
YY1P25490 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
YY1P25490 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
YY1P25490 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
YY1P25490 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
YY1P25490 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
YY1P25490 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
YY1P25490 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
YY1P25490 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
YY1P25490 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
YY1P25490 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
YY1P25490 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
YY1P25490 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
YY1P25490 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YY1P25490 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YY1P25490 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YY1P25490 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
YY1P25490 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
YY1P25490 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
YY1P25490 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
YY1P25490 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
YY1P25490 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
YY1P25490 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
YY1P25490 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
YY1P25490 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
YY1P25490 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
YY1P25490 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
YY1P25490 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
YY1P25490 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
YY1P25490 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YY1P25490 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YY1P25490 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YY1P25490 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YY1P25490 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YY1P25490 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
YY1P25490 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YY1P25490 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YY1P25490 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
YY1P25490 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
YY1P25490 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
YY1P25490 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms