Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR3P25106 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR3P25106 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACKR3P25106 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR3P25106 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR3P25106 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms