Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF4BP23588 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EIF4BP23588 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF4BP23588 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EIF4BP23588 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EIF4BP23588 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4BP23588 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms