Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB2P22676 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB2P22676 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB2P22676 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB2P22676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALB2P22676 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB2P22676 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB2P22676 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB2P22676 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALB2P22676 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB2P22676 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB2P22676 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB2P22676 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB2P22676 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB2P22676 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB2P22676 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB2P22676 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB2P22676 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB2P22676 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB2P22676 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALB2P22676 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALB2P22676 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALB2P22676 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALB2P22676 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALB2P22676 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALB2P22676 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALB2P22676 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALB2P22676 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALB2P22676 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALB2P22676 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALB2P22676 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALB2P22676 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALB2P22676 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALB2P22676 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALB2P22676 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALB2P22676 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALB2P22676 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALB2P22676 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALB2P22676 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALB2P22676 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALB2P22676 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALB2P22676 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALB2P22676 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALB2P22676 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALB2P22676 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALB2P22676 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALB2P22676 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALB2P22676 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALB2P22676 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALB2P22676 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALB2P22676 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALB2P22676 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALB2P22676 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALB2P22676 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALB2P22676 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALB2P22676 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CALB2P22676 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALB2P22676 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALB2P22676 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALB2P22676 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALB2P22676 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALB2P22676 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALB2P22676 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALB2P22676 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALB2P22676 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALB2P22676 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALB2P22676 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALB2P22676 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALB2P22676 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALB2P22676 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALB2P22676 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALB2P22676 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALB2P22676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALB2P22676 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALB2P22676 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALB2P22676 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALB2P22676 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALB2P22676 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALB2P22676 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALB2P22676 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALB2P22676 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALB2P22676 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALB2P22676 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALB2P22676 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALB2P22676 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms