Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN1P21941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN1P21941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN1P21941 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN1P21941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN1P21941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN1P21941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN1P21941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN1P21941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN1P21941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN1P21941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN1P21941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN1P21941 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN1P21941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN1P21941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN1P21941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN1P21941 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN1P21941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN1P21941 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MATN1P21941 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MATN1P21941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN1P21941 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN1P21941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN1P21941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN1P21941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN1P21941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN1P21941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN1P21941 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN1P21941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN1P21941 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN1P21941 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN1P21941 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN1P21941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN1P21941 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN1P21941 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN1P21941 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN1P21941 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN1P21941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN1P21941 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN1P21941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN1P21941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN1P21941 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MATN1P21941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MATN1P21941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN1P21941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MATN1P21941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN1P21941 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN1P21941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN1P21941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN1P21941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN1P21941 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MATN1P21941 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MATN1P21941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MATN1P21941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN1P21941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN1P21941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MATN1P21941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MATN1P21941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN1P21941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN1P21941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN1P21941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN1P21941 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN1P21941 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN1P21941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN1P21941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN1P21941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN1P21941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN1P21941 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN1P21941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN1P21941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN1P21941 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN1P21941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN1P21941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN1P21941 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN1P21941 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN1P21941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN1P21941 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN1P21941 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MATN1P21941 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN1P21941 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN1P21941 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN1P21941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN1P21941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN1P21941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms