Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4BPBP20851 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BPBP20851 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BPBP20851 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BPBP20851 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms