Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL3P20749 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL3P20749 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL3P20749 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL3P20749 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL3P20749 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL3P20749 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL3P20749 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL3P20749 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL3P20749 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL3P20749 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL3P20749 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL3P20749 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL3P20749 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL3P20749 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL3P20749 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL3P20749 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL3P20749 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL3P20749 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL3P20749 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL3P20749 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCL3P20749 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCL3P20749 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCL3P20749 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCL3P20749 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCL3P20749 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCL3P20749 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCL3P20749 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCL3P20749 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCL3P20749 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL3P20749 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL3P20749 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL3P20749 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL3P20749 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL3P20749 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL3P20749 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL3P20749 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL3P20749 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL3P20749 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL3P20749 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL3P20749 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL3P20749 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL3P20749 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL3P20749 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL3P20749 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL3P20749 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCL3P20749 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCL3P20749 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCL3P20749 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCL3P20749 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCL3P20749 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCL3P20749 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL3P20749 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL3P20749 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL3P20749 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL3P20749 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL3P20749 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL3P20749 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL3P20749 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL3P20749 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL3P20749 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL3P20749 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL3P20749 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL3P20749 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL3P20749 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL3P20749 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL3P20749 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL3P20749 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL3P20749 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL3P20749 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL3P20749 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL3P20749 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL3P20749 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL3P20749 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL3P20749 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL3P20749 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL3P20749 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL3P20749 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL3P20749 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL3P20749 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL3P20749 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCL3P20749 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCL3P20749 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCL3P20749 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCL3P20749 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms