Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELK1P19419 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELK1P19419 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELK1P19419 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELK1P19419 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELK1P19419 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELK1P19419 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELK1P19419 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELK1P19419 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELK1P19419 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELK1P19419 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELK1P19419 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK1P19419 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK1P19419 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK1P19419 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK1P19419 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK1P19419 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK1P19419 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK1P19419 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELK1P19419 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELK1P19419 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELK1P19419 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK1P19419 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK1P19419 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK1P19419 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK1P19419 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK1P19419 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK1P19419 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK1P19419 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK1P19419 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK1P19419 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK1P19419 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK1P19419 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK1P19419 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK1P19419 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK1P19419 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK1P19419 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK1P19419 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK1P19419 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK1P19419 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK1P19419 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK1P19419 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK1P19419 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK1P19419 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK1P19419 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK1P19419 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK1P19419 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK1P19419 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK1P19419 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK1P19419 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK1P19419 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELK1P19419 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK1P19419 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK1P19419 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK1P19419 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK1P19419 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK1P19419 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK1P19419 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK1P19419 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK1P19419 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK1P19419 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK1P19419 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK1P19419 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK1P19419 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK1P19419 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK1P19419 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK1P19419 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK1P19419 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK1P19419 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK1P19419 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK1P19419 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK1P19419 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELK1P19419 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELK1P19419 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELK1P19419 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELK1P19419 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELK1P19419 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELK1P19419 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELK1P19419 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELK1P19419 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms