Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF6P18850 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF6P18850 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF6P18850 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF6P18850 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF6P18850 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF6P18850 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF6P18850 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF6P18850 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF6P18850 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF6P18850 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF6P18850 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF6P18850 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF6P18850 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF6P18850 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF6P18850 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF6P18850 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF6P18850 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF6P18850 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF6P18850 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF6P18850 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF6P18850 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF6P18850 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF6P18850 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF6P18850 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF6P18850 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF6P18850 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF6P18850 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF6P18850 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF6P18850 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF6P18850 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF6P18850 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF6P18850 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF6P18850 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF6P18850 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF6P18850 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF6P18850 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF6P18850 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF6P18850 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF6P18850 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF6P18850 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF6P18850 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF6P18850 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF6P18850 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF6P18850 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF6P18850 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF6P18850 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF6P18850 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF6P18850 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF6P18850 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF6P18850 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF6P18850 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF6P18850 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF6P18850 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6P18850 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF6P18850 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF6P18850 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF6P18850 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF6P18850 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF6P18850 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF6P18850 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF6P18850 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF6P18850 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF6P18850 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF6P18850 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF6P18850 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF6P18850 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF6P18850 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF6P18850 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF6P18850 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF6P18850 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF6P18850 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF6P18850 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF6P18850 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF6P18850 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF6P18850 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF6P18850 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF6P18850 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF6P18850 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF6P18850 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF6P18850 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF6P18850 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF6P18850 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF6P18850 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF6P18850 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF6P18850 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF6P18850 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF6P18850 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms