Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBPP18428 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBPP18428 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBPP18428 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBPP18428 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBPP18428 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBPP18428 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBPP18428 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBPP18428 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBPP18428 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBPP18428 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBPP18428 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBPP18428 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBPP18428 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBPP18428 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBPP18428 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBPP18428 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBPP18428 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBPP18428 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LBPP18428 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBPP18428 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBPP18428 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBPP18428 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBPP18428 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBPP18428 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBPP18428 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBPP18428 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBPP18428 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBPP18428 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LBPP18428 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBPP18428 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBPP18428 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBPP18428 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBPP18428 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBPP18428 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBPP18428 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBPP18428 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBPP18428 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBPP18428 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBPP18428 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBPP18428 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBPP18428 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBPP18428 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBPP18428 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBPP18428 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBPP18428 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBPP18428 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LBPP18428 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBPP18428 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBPP18428 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBPP18428 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBPP18428 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBPP18428 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBPP18428 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBPP18428 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBPP18428 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBPP18428 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBPP18428 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBPP18428 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBPP18428 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBPP18428 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBPP18428 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBPP18428 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBPP18428 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBPP18428 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBPP18428 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBPP18428 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBPP18428 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBPP18428 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBPP18428 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBPP18428 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBPP18428 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBPP18428 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBPP18428 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBPP18428 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBPP18428 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LBPP18428 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBPP18428 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBPP18428 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LBPP18428 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LBPP18428 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBPP18428 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBPP18428 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBPP18428 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LBPP18428 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBPP18428 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBPP18428 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LBPP18428 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBPP18428 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBPP18428 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms