Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B1P15313 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B1P15313 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1B1P15313 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1B1P15313 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1B1P15313 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1B1P15313 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B1P15313 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B1P15313 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1B1P15313 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B1P15313 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1B1P15313 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms