Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GSPT1P15170 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GSPT1P15170 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GSPT1P15170 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GSPT1P15170 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GSPT1P15170 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GSPT1P15170 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GSPT1P15170 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
GSPT1P15170 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms