Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTHFD2P13995 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFD2P13995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFD2P13995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD2P13995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD2P13995 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTHFD2P13995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTHFD2P13995 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTHFD2P13995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms