Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT1P13805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNT1P13805 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNT1P13805 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNT1P13805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT1P13805 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT1P13805 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms