Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNAP12004 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNAP12004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNAP12004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNAP12004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNAP12004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNAP12004 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNAP12004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNAP12004 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNAP12004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNAP12004 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNAP12004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNAP12004 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNAP12004 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNAP12004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNAP12004 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNAP12004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNAP12004 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNAP12004 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNAP12004 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNAP12004 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNAP12004 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNAP12004 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNAP12004 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNAP12004 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNAP12004 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNAP12004 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNAP12004 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNAP12004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNAP12004 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNAP12004 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNAP12004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNAP12004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNAP12004 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNAP12004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNAP12004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNAP12004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNAP12004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNAP12004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNAP12004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNAP12004 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNAP12004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNAP12004 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNAP12004 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNAP12004 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNAP12004 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNAP12004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNAP12004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNAP12004 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNAP12004 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNAP12004 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNAP12004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNAP12004 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNAP12004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNAP12004 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNAP12004 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNAP12004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNAP12004 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNAP12004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNAP12004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNAP12004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNAP12004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNAP12004 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNAP12004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNAP12004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNAP12004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNAP12004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNAP12004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNAP12004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNAP12004 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNAP12004 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNAP12004 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNAP12004 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNAP12004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNAP12004 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNAP12004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNAP12004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNAP12004 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNAP12004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNAP12004 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNAP12004 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNAP12004 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNAP12004 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNAP12004 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNAP12004 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNAP12004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNAP12004 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNAP12004 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNAP12004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNAP12004 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNAP12004 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNAP12004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNAP12004 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms