Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARAFP10398 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARAFP10398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARAFP10398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARAFP10398 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARAFP10398 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARAFP10398 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARAFP10398 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARAFP10398 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARAFP10398 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARAFP10398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARAFP10398 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARAFP10398 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARAFP10398 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARAFP10398 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARAFP10398 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARAFP10398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARAFP10398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARAFP10398 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARAFP10398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARAFP10398 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARAFP10398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARAFP10398 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARAFP10398 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARAFP10398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARAFP10398 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARAFP10398 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARAFP10398 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARAFP10398 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARAFP10398 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARAFP10398 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARAFP10398 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARAFP10398 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARAFP10398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARAFP10398 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARAFP10398 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARAFP10398 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARAFP10398 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARAFP10398 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARAFP10398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARAFP10398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARAFP10398 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARAFP10398 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARAFP10398 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARAFP10398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARAFP10398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARAFP10398 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARAFP10398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARAFP10398 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARAFP10398 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARAFP10398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARAFP10398 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARAFP10398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARAFP10398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARAFP10398 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARAFP10398 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARAFP10398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARAFP10398 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARAFP10398 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARAFP10398 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARAFP10398 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARAFP10398 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARAFP10398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARAFP10398 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARAFP10398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARAFP10398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARAFP10398 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARAFP10398 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARAFP10398 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARAFP10398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARAFP10398 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARAFP10398 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARAFP10398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARAFP10398 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARAFP10398 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARAFP10398 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARAFP10398 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARAFP10398 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARAFP10398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARAFP10398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARAFP10398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARAFP10398 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARAFP10398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARAFP10398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAFP10398 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAFP10398 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAFP10398 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAFP10398 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARAFP10398 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAFP10398 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms