Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV1-8P0DP01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV1-8P0DP01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV1-8P0DP01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV1-8P0DP01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV1-8P0DP01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV1-8P0DP01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV1-8P0DP01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-8P0DP01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-8P0DP01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms