Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf88P0DMB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf88P0DMB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf88P0DMB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C8orf88P0DMB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms