Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAA1P0DJI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAA1P0DJI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAA1P0DJI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAA1P0DJI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAA1P0DJI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms