Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBP1P09455 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP1P09455 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP1P09455 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP1P09455 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP1P09455 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP1P09455 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP1P09455 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP1P09455 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP1P09455 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP1P09455 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP1P09455 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP1P09455 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP1P09455 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP1P09455 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP1P09455 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP1P09455 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBP1P09455 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBP1P09455 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RBP1P09455 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBP1P09455 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP1P09455 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP1P09455 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP1P09455 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP1P09455 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP1P09455 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP1P09455 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP1P09455 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP1P09455 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP1P09455 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP1P09455 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP1P09455 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP1P09455 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP1P09455 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP1P09455 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP1P09455 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP1P09455 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP1P09455 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBP1P09455 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP1P09455 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP1P09455 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP1P09455 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP1P09455 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP1P09455 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP1P09455 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP1P09455 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP1P09455 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBP1P09455 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP1P09455 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP1P09455 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP1P09455 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP1P09455 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP1P09455 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBP1P09455 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP1P09455 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP1P09455 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP1P09455 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RBP1P09455 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP1P09455 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP1P09455 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP1P09455 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBP1P09455 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP1P09455 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP1P09455 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP1P09455 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP1P09455 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBP1P09455 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBP1P09455 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBP1P09455 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBP1P09455 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBP1P09455 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBP1P09455 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBP1P09455 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBP1P09455 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBP1P09455 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBP1P09455 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBP1P09455 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBP1P09455 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBP1P09455 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBP1P09455 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBP1P09455 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBP1P09455 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBP1P09455 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RBP1P09455 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBP1P09455 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms