Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PKHD1P08F94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKHD1P08F94 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKHD1P08F94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKHD1P08F94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms