Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MGPP08493 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MGPP08493 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MGPP08493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MGPP08493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MGPP08493 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MGPP08493 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MGPP08493 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MGPP08493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MGPP08493 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MGPP08493 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MGPP08493 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
MGPP08493 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MGPP08493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MGPP08493 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MGPP08493 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MGPP08493 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MGPP08493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MGPP08493 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MGPP08493 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MGPP08493 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MGPP08493 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MGPP08493 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MGPP08493 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MGPP08493 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGPP08493 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGPP08493 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGPP08493 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGPP08493 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGPP08493 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGPP08493 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGPP08493 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGPP08493 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGPP08493 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGPP08493 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGPP08493 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGPP08493 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MGPP08493 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MGPP08493 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MGPP08493 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MGPP08493 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MGPP08493 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MGPP08493 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MGPP08493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MGPP08493 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MGPP08493 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MGPP08493 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MGPP08493 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MGPP08493 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MGPP08493 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MGPP08493 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MGPP08493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MGPP08493 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MGPP08493 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MGPP08493 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MGPP08493 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MGPP08493 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MGPP08493 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MGPP08493 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MGPP08493 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MGPP08493 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MGPP08493 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MGPP08493 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MGPP08493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MGPP08493 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MGPP08493 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MGPP08493 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MGPP08493 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MGPP08493 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MGPP08493 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MGPP08493 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MGPP08493 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MGPP08493 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MGPP08493 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MGPP08493 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MGPP08493 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms