Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms