Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYNP07948 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LYNP07948 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYNP07948 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYNP07948 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYNP07948 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYNP07948 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LYNP07948 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYNP07948 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYNP07948 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYNP07948 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYNP07948 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LYNP07948 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LYNP07948 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LYNP07948 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LYNP07948 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYNP07948 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYNP07948 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYNP07948 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYNP07948 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYNP07948 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYNP07948 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYNP07948 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYNP07948 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYNP07948 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYNP07948 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYNP07948 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYNP07948 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYNP07948 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYNP07948 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYNP07948 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYNP07948 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYNP07948 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYNP07948 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYNP07948 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYNP07948 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYNP07948 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYNP07948 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYNP07948 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYNP07948 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYNP07948 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYNP07948 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYNP07948 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYNP07948 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYNP07948 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYNP07948 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYNP07948 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYNP07948 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYNP07948 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYNP07948 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYNP07948 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYNP07948 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYNP07948 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYNP07948 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYNP07948 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYNP07948 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYNP07948 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYNP07948 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYNP07948 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYNP07948 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYNP07948 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYNP07948 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYNP07948 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYNP07948 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYNP07948 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYNP07948 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYNP07948 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYNP07948 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYNP07948 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYNP07948 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYNP07948 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYNP07948 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYNP07948 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYNP07948 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LYNP07948 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYNP07948 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYNP07948 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYNP07948 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYNP07948 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYNP07948 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYNP07948 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYNP07948 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYNP07948 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYNP07948 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYNP07948 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYNP07948 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYNP07948 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYNP07948 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYNP07948 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYNP07948 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYNP07948 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYNP07948 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYNP07948 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNP07948 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms