Protein–RNA interactions for Protein: P07339

CTSD, Cathepsin D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSDP07339 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSDP07339 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSDP07339 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSDP07339 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSDP07339 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSDP07339 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSDP07339 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSDP07339 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSDP07339 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSDP07339 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSDP07339 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSDP07339 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSDP07339 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSDP07339 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSDP07339 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSDP07339 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSDP07339 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSDP07339 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSDP07339 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSDP07339 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSDP07339 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSDP07339 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSDP07339 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSDP07339 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSDP07339 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSDP07339 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSDP07339 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSDP07339 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSDP07339 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSDP07339 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSDP07339 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSDP07339 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSDP07339 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSDP07339 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSDP07339 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSDP07339 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSDP07339 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSDP07339 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSDP07339 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSDP07339 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSDP07339 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSDP07339 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSDP07339 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSDP07339 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSDP07339 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSDP07339 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSDP07339 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSDP07339 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSDP07339 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSDP07339 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSDP07339 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSDP07339 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSDP07339 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSDP07339 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSDP07339 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSDP07339 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSDP07339 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSDP07339 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSDP07339 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSDP07339 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSDP07339 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSDP07339 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSDP07339 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSDP07339 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSDP07339 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSDP07339 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSDP07339 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSDP07339 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSDP07339 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSDP07339 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSDP07339 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSDP07339 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSDP07339 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSDP07339 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSDP07339 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSDP07339 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSDP07339 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSDP07339 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSDP07339 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSDP07339 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSDP07339 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms