Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CENPBP07199 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CENPBP07199 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CENPBP07199 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CENPBP07199 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CENPBP07199 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CENPBP07199 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CENPBP07199 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CENPBP07199 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CENPBP07199 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CENPBP07199 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CENPBP07199 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CENPBP07199 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CENPBP07199 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CENPBP07199 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CENPBP07199 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CENPBP07199 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CENPBP07199 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CENPBP07199 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CENPBP07199 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CENPBP07199 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CENPBP07199 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CENPBP07199 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CENPBP07199 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CENPBP07199 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CENPBP07199 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CENPBP07199 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CENPBP07199 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CENPBP07199 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CENPBP07199 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CENPBP07199 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CENPBP07199 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CENPBP07199 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CENPBP07199 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CENPBP07199 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CENPBP07199 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CENPBP07199 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CENPBP07199 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CENPBP07199 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CENPBP07199 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPBP07199 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPBP07199 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPBP07199 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPBP07199 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPBP07199 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPBP07199 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CENPBP07199 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CENPBP07199 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CENPBP07199 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CENPBP07199 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CENPBP07199 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CENPBP07199 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPBP07199 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPBP07199 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPBP07199 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPBP07199 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CENPBP07199 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CENPBP07199 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CENPBP07199 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CENPBP07199 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CENPBP07199 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CENPBP07199 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CENPBP07199 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CENPBP07199 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CENPBP07199 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CENPBP07199 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CENPBP07199 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CENPBP07199 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CENPBP07199 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CENPBP07199 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPBP07199 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPBP07199 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CENPBP07199 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CENPBP07199 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CENPBP07199 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CENPBP07199 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CENPBP07199 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CENPBP07199 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CENPBP07199 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CENPBP07199 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CENPBP07199 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CENPBP07199 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CENPBP07199 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CENPBP07199 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CENPBP07199 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CENPBP07199 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CENPBP07199 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CENPBP07199 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CENPBP07199 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CENPBP07199 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CENPBP07199 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CENPBP07199 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CENPBP07199 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CENPBP07199 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CENPBP07199 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms