Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPN2P04844 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPN2P04844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPN2P04844 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPN2P04844 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPN2P04844 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPN2P04844 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPN2P04844 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPN2P04844 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPN2P04844 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPN2P04844 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPN2P04844 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPN2P04844 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPN2P04844 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPN2P04844 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPN2P04844 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPN2P04844 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPN2P04844 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPN2P04844 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPN2P04844 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPN2P04844 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPN2P04844 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPN2P04844 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPN2P04844 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPN2P04844 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPN2P04844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPN2P04844 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPN2P04844 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPN2P04844 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPN2P04844 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPN2P04844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPN2P04844 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPN2P04844 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPN2P04844 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN2P04844 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN2P04844 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN2P04844 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN2P04844 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN2P04844 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN2P04844 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN2P04844 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN2P04844 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN2P04844 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN2P04844 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN2P04844 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN2P04844 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN2P04844 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN2P04844 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN2P04844 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN2P04844 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN2P04844 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN2P04844 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN2P04844 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN2P04844 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN2P04844 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN2P04844 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN2P04844 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN2P04844 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN2P04844 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN2P04844 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN2P04844 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN2P04844 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN2P04844 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN2P04844 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN2P04844 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN2P04844 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN2P04844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN2P04844 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN2P04844 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN2P04844 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN2P04844 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN2P04844 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN2P04844 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN2P04844 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN2P04844 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPN2P04844 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN2P04844 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN2P04844 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms