Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB4AP04350 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB4AP04350 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4AP04350 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4AP04350 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4AP04350 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUBB4AP04350 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4AP04350 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms