Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTRP02766 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTRP02766 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTRP02766 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTRP02766 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTRP02766 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTRP02766 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTRP02766 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTRP02766 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTRP02766 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTRP02766 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTRP02766 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTRP02766 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTRP02766 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTRP02766 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTRP02766 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTRP02766 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTRP02766 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTRP02766 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTRP02766 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTRP02766 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTRP02766 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTRP02766 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTRP02766 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTRP02766 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTRP02766 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTRP02766 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTRP02766 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTRP02766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTRP02766 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTRP02766 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTRP02766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTRP02766 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTRP02766 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTRP02766 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTRP02766 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTRP02766 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTRP02766 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTRP02766 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTRP02766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTRP02766 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTRP02766 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTRP02766 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTRP02766 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTRP02766 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTRP02766 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTRP02766 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTRP02766 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTRP02766 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTRP02766 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTRP02766 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTRP02766 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TTRP02766 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTRP02766 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTRP02766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTRP02766 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTRP02766 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTRP02766 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTRP02766 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTRP02766 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTRP02766 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTRP02766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTRP02766 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTRP02766 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTRP02766 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTRP02766 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTRP02766 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTRP02766 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTRP02766 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTRP02766 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTRP02766 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTRP02766 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTRP02766 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTRP02766 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTRP02766 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTRP02766 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTRP02766 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTRP02766 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTRP02766 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTRP02766 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTRP02766 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms