Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH8O95206 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH8O95206 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH8O95206 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH8O95206 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDH8O95206 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH8O95206 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms