Protein–RNA interactions for Protein: O76075

DFFB, DNA fragmentation factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFBO76075 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFBO76075 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFBO76075 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFBO76075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFBO76075 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFBO76075 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFBO76075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFBO76075 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFBO76075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFBO76075 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFBO76075 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFBO76075 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFBO76075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFBO76075 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFBO76075 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFBO76075 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFBO76075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DFFBO76075 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFBO76075 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFBO76075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFBO76075 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFBO76075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFBO76075 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFBO76075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFBO76075 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFBO76075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFBO76075 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFBO76075 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFBO76075 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFBO76075 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFBO76075 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFBO76075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFBO76075 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFBO76075 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFBO76075 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFBO76075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFBO76075 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFBO76075 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFBO76075 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFBO76075 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFBO76075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFBO76075 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFBO76075 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFBO76075 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFBO76075 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFBO76075 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFBO76075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFBO76075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFBO76075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFBO76075 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFBO76075 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFBO76075 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFBO76075 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFBO76075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFBO76075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFBO76075 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DFFBO76075 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFBO76075 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DFFBO76075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DFFBO76075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFBO76075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DFFBO76075 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFBO76075 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFBO76075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFBO76075 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFBO76075 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFBO76075 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFBO76075 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFBO76075 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFBO76075 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFBO76075 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFBO76075 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFBO76075 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFBO76075 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFBO76075 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFBO76075 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFBO76075 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFBO76075 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFBO76075 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFBO76075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFBO76075 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFBO76075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFBO76075 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFBO76075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFBO76075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms