Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DYSFO75923 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DYSFO75923 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DYSFO75923 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYSFO75923 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DYSFO75923 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYSFO75923 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYSFO75923 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYSFO75923 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYSFO75923 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYSFO75923 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYSFO75923 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYSFO75923 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYSFO75923 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYSFO75923 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYSFO75923 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYSFO75923 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYSFO75923 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DYSFO75923 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYSFO75923 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYSFO75923 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYSFO75923 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYSFO75923 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYSFO75923 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYSFO75923 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYSFO75923 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYSFO75923 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYSFO75923 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYSFO75923 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYSFO75923 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYSFO75923 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYSFO75923 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYSFO75923 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYSFO75923 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYSFO75923 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYSFO75923 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYSFO75923 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYSFO75923 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYSFO75923 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYSFO75923 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYSFO75923 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYSFO75923 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYSFO75923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYSFO75923 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYSFO75923 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYSFO75923 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYSFO75923 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYSFO75923 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYSFO75923 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYSFO75923 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYSFO75923 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYSFO75923 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYSFO75923 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYSFO75923 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYSFO75923 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYSFO75923 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYSFO75923 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYSFO75923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYSFO75923 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DYSFO75923 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYSFO75923 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYSFO75923 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DYSFO75923 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYSFO75923 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DYSFO75923 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYSFO75923 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYSFO75923 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYSFO75923 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYSFO75923 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DYSFO75923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms