Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK1BO75841 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK1BO75841 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK1BO75841 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPK1BO75841 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK1BO75841 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK1BO75841 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK1BO75841 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms