Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EIF3JO75822 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EIF3JO75822 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EIF3JO75822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
EIF3JO75822 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
EIF3JO75822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EIF3JO75822 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms