Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALMO75781 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PALMO75781 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALMO75781 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALMO75781 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALMO75781 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALMO75781 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALMO75781 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALMO75781 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALMO75781 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALMO75781 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALMO75781 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALMO75781 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALMO75781 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALMO75781 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALMO75781 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALMO75781 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALMO75781 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALMO75781 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALMO75781 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALMO75781 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALMO75781 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALMO75781 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALMO75781 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALMO75781 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALMO75781 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PALMO75781 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALMO75781 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALMO75781 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALMO75781 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALMO75781 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALMO75781 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALMO75781 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALMO75781 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALMO75781 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALMO75781 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALMO75781 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALMO75781 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PALMO75781 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALMO75781 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALMO75781 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALMO75781 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALMO75781 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALMO75781 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALMO75781 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALMO75781 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALMO75781 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALMO75781 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALMO75781 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALMO75781 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALMO75781 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALMO75781 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALMO75781 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALMO75781 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALMO75781 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALMO75781 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALMO75781 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALMO75781 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALMO75781 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALMO75781 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALMO75781 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALMO75781 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALMO75781 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALMO75781 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALMO75781 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALMO75781 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALMO75781 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALMO75781 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALMO75781 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALMO75781 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALMO75781 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALMO75781 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALMO75781 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALMO75781 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PALMO75781 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALMO75781 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALMO75781 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALMO75781 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALMO75781 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALMO75781 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PALMO75781 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALMO75781 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALMO75781 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALMO75781 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALMO75781 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALMO75781 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALMO75781 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PALMO75781 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALMO75781 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALMO75781 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALMO75781 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALMO75781 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALMO75781 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALMO75781 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALMO75781 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMO75781 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMO75781 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMO75781 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMO75781 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMO75781 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms