Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFPL2O75678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFPL2O75678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFPL2O75678 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFPL2O75678 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFPL2O75678 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFPL2O75678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RFPL2O75678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RFPL2O75678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFPL2O75678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFPL2O75678 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms