Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BANF1O75531 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BANF1O75531 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BANF1O75531 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BANF1O75531 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BANF1O75531 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BANF1O75531 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BANF1O75531 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BANF1O75531 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BANF1O75531 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BANF1O75531 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BANF1O75531 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BANF1O75531 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BANF1O75531 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BANF1O75531 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BANF1O75531 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BANF1O75531 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BANF1O75531 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BANF1O75531 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BANF1O75531 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BANF1O75531 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BANF1O75531 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BANF1O75531 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BANF1O75531 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BANF1O75531 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BANF1O75531 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BANF1O75531 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BANF1O75531 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BANF1O75531 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BANF1O75531 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BANF1O75531 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BANF1O75531 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BANF1O75531 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BANF1O75531 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BANF1O75531 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BANF1O75531 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BANF1O75531 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BANF1O75531 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BANF1O75531 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BANF1O75531 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BANF1O75531 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BANF1O75531 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BANF1O75531 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BANF1O75531 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BANF1O75531 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BANF1O75531 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BANF1O75531 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BANF1O75531 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BANF1O75531 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BANF1O75531 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BANF1O75531 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BANF1O75531 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BANF1O75531 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BANF1O75531 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BANF1O75531 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BANF1O75531 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BANF1O75531 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BANF1O75531 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BANF1O75531 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BANF1O75531 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BANF1O75531 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BANF1O75531 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BANF1O75531 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BANF1O75531 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BANF1O75531 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BANF1O75531 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BANF1O75531 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BANF1O75531 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BANF1O75531 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BANF1O75531 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BANF1O75531 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BANF1O75531 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BANF1O75531 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BANF1O75531 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BANF1O75531 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BANF1O75531 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BANF1O75531 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BANF1O75531 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BANF1O75531 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BANF1O75531 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BANF1O75531 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BANF1O75531 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BANF1O75531 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BANF1O75531 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BANF1O75531 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BANF1O75531 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BANF1O75531 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BANF1O75531 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BANF1O75531 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BANF1O75531 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BANF1O75531 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BANF1O75531 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms