Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF21O75509 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF21O75509 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF21O75509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF21O75509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF21O75509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF21O75509 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms