Protein–RNA interactions for Protein: O75185

ATP2C2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2O75185 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2C2O75185 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2C2O75185 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2C2O75185 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C2O75185 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C2O75185 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C2O75185 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms