Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20BO75063 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20BO75063 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20BO75063 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM20BO75063 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20BO75063 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms