Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN2O60636 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN2O60636 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN2O60636 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN2O60636 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN2O60636 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN2O60636 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms